เขาได้มุ่งหน้าสู่ระดับมหาวิทยาลัย

ในช่วงฤดูกาลแรกที่รัฐไอโอวา ฮาลิเบอร์ตัน กลายเป็นหนึ่งในผู้เล่นชั้นนำของทีมอย่างรวดเร็ว เขาได้คะแนนเฉลี่ย 6.8 แต้ม 3.6 รีบาวด์ และ 3.6 แอสซิสต์ต่อเกม ทำให้ได้ตำแหน่งในทีมน้องใหม่ 12 อันดับแรก ฤดูกาลที่ 2 ของเขานั้นน่าประทับใจยิ่งกว่า โดยเขาเฉลี่ย 15.2 คะแนน 6.5 แอสซิสต์ และ 5.9 รีบาวน์ต่อเกม เขาได้รับการเสนอชื่อให้ติด All-Big 12 First Team และเป็นเอกฉันท์ Second Team All-American